近日，GPB在线发表了中国医学科学院“本草基因组协同创新团队”首席专家宋经元课题组题为“ComparativeGenomeAnalysisofScutellariabaicalensisandScutellariabarbataRevealstheEvolutionofActiveFlavonoidBiosynthesis”的研究论文。我们的“要文译荐”栏目很高兴邀请到共同第一作者高冉冉博士为大家解读《中华人民共和国药典》收载的唇形科*芩属药用植物*芩和半枝莲的基因组及其利用研究。
要点介绍研究问题:*芩属药用植物全基因组解析及其*酮类成分生物合成进化机制研究研究方法:联合二代及三代测序技术、Hi-C染色体构象捕获技术等破译*芩属药用植物*芩与半枝莲染色体水平基因组；通过OrthoFinder方法对候选物种的单拷贝直系同源基因进行鉴定并构建系统发育树揭示物种起源及进化；基于同源基因的同义替换速率研究揭示候选物种的分化及全基因组复制事件；通过PFAM、BLASTP等方法注释及挖掘*酮类成分生物合成相关基因；基因组共线性及系统进化分析揭示候选基因的进化机制。主要成果1:报道了*芩和半枝莲的染色体水平基因组序列。主要成果2:发现*芩和半枝莲的分化时间远早于之前的报道，鉴定唇形科与胡麻科共享的全基因组复制事件。主要成果3:揭示了*芩和半枝莲*酮合成途径的趋异进化，如PAL和CHS在*芩中特异的串联复制，4CL在半枝莲中特异的扩张。主要成果4:鉴定了*芩与半枝莲物种形成后*酮羟化酶（F6H和F8H）的串联复制及功能分化情况。背景介绍*芩（Scutellariabaicalensis）和半枝莲（Scutellariabarbata）均为唇形科*芩属药用植物，*芩的干燥根及半枝莲的干燥全草是常用中药，具有清热解*的功效。*芩属约有–个物种，唯有*芩和半枝莲被《中华人民共和国药典》收载。新型冠状病*肺炎（COVID-19）正肆虐全球，中医药在新冠诊治方面发挥积极作用，清热解*药——*芩受到